More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1289 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  75.41 
 
 		 425 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 426 aa  880    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  50.95 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  51.18 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  52.78 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  52.37 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  50.71 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  50.47 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  50.71 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  50.71 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  50.94 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  49.41 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  48.82 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  49.05 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  48.82 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  51.18 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  49.76 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  48.69 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  49.17 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  47.74 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  47.87 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  49.52 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  51.24 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  49.05 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  47.88 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  53.28 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  48.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  48.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  51.08 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  50.71 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  48.81 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  48.34 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  49.05 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  48.7 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  48.59 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  50.99 
 
 		 446 aa  418  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  48.7 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  49.06 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  49.76 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  47.29 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  49.06 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  48.71 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  50.95 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  49.51 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  49.53 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  49.52 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  50.36 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  47.64 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  46.9 
 
 		 421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  49.17 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  48.56 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  48.33 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  50 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  46.82 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  46.59 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  48.34 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  45.95 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  45.01 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  48.94 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  49.17 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  47.63 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
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NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  49.18 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  47.16 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.16 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  47.16 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0396  4-aminobutyrate transaminase  49.05 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.925328  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  48.82 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
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