More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0007 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  75.41 
 
 		 426 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  100 
 
 		 425 aa  879    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  51.18 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  50.35 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  49.53 
 
 		 426 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  50.51 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  46.93 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  48.69 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 425 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  48.69 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  48.69 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  48.69 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  46.82 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  48.1 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 425 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  51.3 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  49.17 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  50.12 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  49.76 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  50.36 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.62 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  47.98 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  48.1 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  47.87 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  48.94 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  48.35 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  47.63 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  47.63 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  47.63 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  47.16 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  47.16 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  47.29 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  49.27 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.11 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  46.68 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  47.87 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  47.03 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  47.03 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.03 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  47.64 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  50.84 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  49.28 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  46.19 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  46.56 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  47.73 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  46.43 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  46.68 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  49.17 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  46.9 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  47.02 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  47.73 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  48.34 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  47.57 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  47.49 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  44.15 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  49.29 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  46.7 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  46.41 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  47.14 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  47.28 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  46.92 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  46.67 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  46.92 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  46.68 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  46.92 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  45.56 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  47.39 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2127  4-aminobutyrate transaminase  46.95 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0396  4-aminobutyrate transaminase  46.95 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.925328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  47.39 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  47.18 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0810  4-aminobutyrate transaminase  47.18 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.622888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1822  4-aminobutyrate transaminase  46.95 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0494  4-aminobutyrate transaminase  47.18 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  45.33 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  47.19 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1335  4-aminobutyrate aminotransferase  45.33 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  46.3 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  47.39 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  47.39 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  46.81 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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