More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3663 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 445 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  81.45 
 
 		 448 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  73.39 
 
 		 453 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  71.46 
 
 		 450 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  66.52 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  68.46 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  64.16 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  64.16 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  64.16 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  64.55 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  65.83 
 
 		 450 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  65.47 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  66.82 
 
 		 451 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  64.67 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  71.75 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  64.37 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  63.47 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  62.95 
 
 		 456 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  65.83 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  65.32 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  58.47 
 
 		 440 aa  481  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  63.45 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  58.56 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  62.39 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  49.09 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  54.04 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  48.4 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  47.86 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  46.77 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  48.17 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  47.95 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  50 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  51.04 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  49.78 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  46.15 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  48.48 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  50.47 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  47.78 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  50.7 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  47.65 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  51.06 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  48.94 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  45.9 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  46.12 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  45.99 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  46.97 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  50.6 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  47.64 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  48 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  46.12 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  46.12 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  49.16 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  45.75 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  45.88 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  46.95 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  45.75 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  45.75 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  48.01 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  48.36 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  48.57 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  45.83 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  48.68 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  46.21 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  45.28 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  48.2 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  47.69 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  49.19 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  47.14 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  46.3 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.66 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.05 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  48.22 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  45.39 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  45.39 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  45.39 
 
 		 429 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  47.04 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  45.63 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  44.44 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>