More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4960 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 432 aa  869    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  75.06 
 
 		 451 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  68.82 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  70.96 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  68.06 
 
 		 453 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  72.09 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  66.21 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  66.21 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  66.21 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  67.45 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  66.21 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  66.97 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  66.44 
 
 		 456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  66.59 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  70.96 
 
 		 452 aa  554  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  65.36 
 
 		 445 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  65.83 
 
 		 449 aa  531  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  65.01 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  63.23 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  68.15 
 
 		 450 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  60.05 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  65.29 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  60 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  65.02 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  47.25 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  48.39 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  49.19 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  43.75 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  43.52 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  46.81 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  46.5 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  46.1 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  46.57 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  46.1 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  47.69 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  43.06 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  46.83 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  47.22 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  46.17 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  48.71 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  49.05 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  45.39 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  47.29 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  44.58 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.21 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  45.71 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  44.34 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  44.34 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  44.92 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.21 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  46.51 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  44.78 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  47.41 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  45.32 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  43.36 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  48.42 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  43.03 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 427 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  44.71 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  47.75 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.26 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  43.33 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  44.14 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  46.27 
 
 		 434 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  44.47 
 
 		 450 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  47.58 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  43.81 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  45.41 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  46.76 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  45.24 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>