More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3205 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 450 aa  905    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  70.02 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  69.84 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  64.93 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  65.37 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  65.45 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  65.45 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  65.45 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  66.51 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  64.99 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  64.09 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  64.32 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  63.6 
 
 		 456 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  66.29 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  69.43 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  65.83 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  63.51 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  63.3 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  63.86 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  66.89 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  62.7 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  59.77 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  64 
 
 		 475 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  62.87 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  43.71 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  43.25 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  43.48 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  42.66 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  47.34 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 454 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  43.74 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  41.96 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  45.32 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  46.08 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  46.24 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  45.28 
 
 		 427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  45.77 
 
 		 450 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  45.24 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  45.79 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  45.54 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  44.58 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  46.28 
 
 		 427 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 420 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  44.02 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  43.78 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  44.02 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  44.02 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  43.88 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  45.11 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  44.02 
 
 		 426 aa  348  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  42.89 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  48.54 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  43.88 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  43.65 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  44.36 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  44.36 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  43.65 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.87 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  44.6 
 
 		 427 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  45.15 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  45.69 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  43.51 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  47.43 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  44.02 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  44.42 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  44.58 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  46.73 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  44.5 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  42.06 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  45.21 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  45.19 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 		 426 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  44.95 
 
 		 425 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  43.03 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  45.63 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  47.68 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  47.19 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.17 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  45.97 
 
 		 428 aa  336  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  45.58 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  44.44 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>