More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4056 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  100 
 
 
446 aa  919    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  48.26 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  42.07 
 
 
437 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  39.06 
 
 
448 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  41.48 
 
 
444 aa  300  4e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  41.73 
 
 
445 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  42.2 
 
 
427 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  41.97 
 
 
442 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  38.73 
 
 
428 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  39.59 
 
 
442 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  39.75 
 
 
452 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.19 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  41.05 
 
 
453 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  38.66 
 
 
436 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 
454 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 
454 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  40.86 
 
 
458 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.71 
 
 
395 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  38.94 
 
 
446 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  39.64 
 
 
441 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 
454 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  40 
 
 
432 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  37.39 
 
 
396 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  38.37 
 
 
430 aa  274  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 
479 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 
431 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  39.66 
 
 
453 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  39.43 
 
 
427 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.88 
 
 
457 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  37.23 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  36.17 
 
 
454 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 
399 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  37.21 
 
 
459 aa  267  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 
454 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 
396 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  37.98 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 
427 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  37.61 
 
 
402 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  37.31 
 
 
461 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  36.8 
 
 
427 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.76 
 
 
391 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  40.72 
 
 
448 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 
438 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  37.41 
 
 
452 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  41.25 
 
 
448 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
390 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  36.95 
 
 
421 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  37.69 
 
 
450 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.45 
 
 
395 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  37.29 
 
 
450 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.85 
 
 
465 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.65 
 
 
386 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.57 
 
 
477 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  38.97 
 
 
439 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  37.85 
 
 
432 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  39.17 
 
 
418 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 
394 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  41.56 
 
 
471 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.84 
 
 
397 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  35.29 
 
 
450 aa  256  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  36.52 
 
 
395 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  37.76 
 
 
448 aa  255  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  35.93 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  35.93 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  35.7 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  39.09 
 
 
450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.95 
 
 
477 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  35.7 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.24 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  35.7 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.13 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  35.93 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 
429 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  35.7 
 
 
449 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  35.46 
 
 
450 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.09 
 
 
420 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  37.14 
 
 
451 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.44 
 
 
459 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.44 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.44 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  35.46 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.19 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.68 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  36.01 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  37.59 
 
 
428 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.41 
 
 
458 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 
429 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>