More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3540 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  94.16 
 
 
459 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  99.77 
 
 
468 aa  879    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  99.77 
 
 
429 aa  877    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  100 
 
 
429 aa  879    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  75.58 
 
 
472 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  99.53 
 
 
429 aa  876    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  99.77 
 
 
429 aa  878    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  76.78 
 
 
477 aa  685    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  93.93 
 
 
459 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  77.73 
 
 
477 aa  690    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  94.16 
 
 
459 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  99.77 
 
 
459 aa  879    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  77.3 
 
 
472 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  100 
 
 
459 aa  880    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  94.39 
 
 
459 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  94.16 
 
 
459 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  93.71 
 
 
459 aa  832    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  99.3 
 
 
429 aa  873    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  63.03 
 
 
457 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  50.61 
 
 
450 aa  428  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  46.19 
 
 
411 aa  348  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  46.15 
 
 
411 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  42.44 
 
 
462 aa  339  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  45.23 
 
 
475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  43.24 
 
 
460 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  43.78 
 
 
475 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  42.93 
 
 
467 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  42.99 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  41.12 
 
 
460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  45.43 
 
 
468 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  39.76 
 
 
891 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  41.63 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.25 
 
 
393 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  37.89 
 
 
438 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
390 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.65 
 
 
393 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
458 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  39.23 
 
 
845 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 
403 aa  270  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.37 
 
 
392 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
391 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  39.78 
 
 
394 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  39.78 
 
 
394 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 
398 aa  260  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  39.23 
 
 
385 aa  260  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  37.31 
 
 
955 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  39.49 
 
 
385 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  38.26 
 
 
408 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  38.36 
 
 
399 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.11 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
395 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 
391 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  34.46 
 
 
460 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  37.44 
 
 
446 aa  252  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.4 
 
 
389 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  38.22 
 
 
427 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  38.26 
 
 
415 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
397 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  40.11 
 
 
390 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  37.3 
 
 
399 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 
403 aa  250  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  39.29 
 
 
457 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  39.67 
 
 
462 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  40.27 
 
 
403 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38.74 
 
 
397 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
398 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  36.8 
 
 
386 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.12 
 
 
432 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  35.17 
 
 
403 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 
394 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0221  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.5 
 
 
392 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 
397 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.47 
 
 
395 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  41.35 
 
 
403 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.64 
 
 
398 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  36.69 
 
 
418 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.58 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  33.95 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.74 
 
 
395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.61 
 
 
401 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.04 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  36 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.81 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.47 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  37.57 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.84 
 
 
441 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.24 
 
 
385 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  36.13 
 
 
476 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  38.38 
 
 
403 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3615  aminotransferase class-III  37.44 
 
 
426 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  39.26 
 
 
444 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.9 
 
 
436 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
415 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 
423 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>