More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2386 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  100 
 
 		 471 aa  973    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  46.71 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  46.39 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  43.25 
 
 		 452 aa  358  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  42.02 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  43.93 
 
 		 439 aa  339  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  41.48 
 
 		 465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  42.21 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  41.07 
 
 		 465 aa  333  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  43.63 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.67 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  41.94 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  45.07 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  43.61 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  43.96 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  44.1 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  41.31 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  41.32 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  41.84 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  40.79 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  44.71 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  40.05 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  38.23 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  39.46 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  39.05 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  38.62 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  39.46 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  39.04 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  41.91 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.04 
 
 		 468 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  38.66 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  37.73 
 
 		 454 aa  282  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  38.02 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  39.47 
 
 		 445 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  39.81 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.18 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  39.21 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 395 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  37.02 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.9 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  37.21 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  38.69 
 
 		 440 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  41.56 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  37.1 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.25 
 
 		 420 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  38.32 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  35.17 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 		 425 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  34.14 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  36.63 
 
 		 419 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  37.69 
 
 		 424 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  37.16 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  35.43 
 
 		 452 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  38.33 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  36.34 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  39.41 
 
 		 426 aa  256  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  37.44 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  35.1 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  34.87 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  35.94 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 426 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  38 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  36.63 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  36.63 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  37.47 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.93 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 		 427 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  36.76 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  37.01 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 439 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  37.63 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.43 
 
 		 457 aa  250  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 		 427 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  36.66 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  37.62 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  37.62 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  37.62 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  37.62 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>