More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1048 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  70.64 
 
 
460 aa  667    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  100 
 
 
462 aa  940    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  69.8 
 
 
460 aa  634  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  64.37 
 
 
452 aa  600  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  41.53 
 
 
457 aa  338  8e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  38.46 
 
 
440 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.86 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  39.62 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  36.81 
 
 
540 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6164  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.01 
 
 
455 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.53 
 
 
456 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  37.21 
 
 
958 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2287  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.44 
 
 
474 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.84 
 
 
468 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.07 
 
 
473 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  35.87 
 
 
961 aa  292  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.96 
 
 
967 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.41 
 
 
462 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  35.99 
 
 
963 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.05 
 
 
470 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  39.1 
 
 
469 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  39.1 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3548  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.82 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.39 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.91 
 
 
469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
444 aa  282  9e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.93 
 
 
470 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.16 
 
 
458 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  37.25 
 
 
458 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.51 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4223  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 
452 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.51 
 
 
465 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 
463 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  37.01 
 
 
436 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.26 
 
 
450 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0532  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.301998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.04 
 
 
479 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  36.18 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3790  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 
463 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.755315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
478 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.03 
 
 
452 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
454 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
454 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
454 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.81 
 
 
454 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 
454 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.07 
 
 
460 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 
454 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 
468 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.58 
 
 
432 aa  269  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.4 
 
 
431 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.52 
 
 
461 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.9 
 
 
439 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 
459 aa  262  8e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  39.08 
 
 
419 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4220  aminotransferase  38.07 
 
 
469 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  36.04 
 
 
443 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  34.99 
 
 
471 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  35.81 
 
 
448 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  37.14 
 
 
453 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  256  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1806  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.48 
 
 
484 aa  255  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000212834  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  35.37 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.5 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.72 
 
 
460 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.72 
 
 
460 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 
441 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  36.43 
 
 
427 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  36.63 
 
 
450 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.86 
 
 
927 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.86 
 
 
927 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.86 
 
 
927 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.86 
 
 
927 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.86 
 
 
927 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
458 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 
927 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.1 
 
 
927 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  34.01 
 
 
442 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  34.96 
 
 
445 aa  249  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  37.59 
 
 
417 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.57 
 
 
464 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  39.34 
 
 
418 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  36.34 
 
 
448 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  35.57 
 
 
446 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  36.2 
 
 
456 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  35.57 
 
 
446 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  35.57 
 
 
446 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  36.84 
 
 
446 aa  247  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0354  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.62 
 
 
430 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244912  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  34.85 
 
 
450 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  37.33 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  35.25 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>