More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0275 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 417 aa  841    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  69.83 
 
 		 418 aa  620  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  51.78 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  51.53 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  50.84 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  51.56 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  50.35 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  42.41 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  41.23 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  42.66 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  40.85 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  42.4 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  40.92 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  40.66 
 
 		 461 aa  325  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  41.29 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  41.84 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  41.36 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  44.87 
 
 		 448 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  39.7 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  38.95 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.76 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.93 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 448 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.96 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.51 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  39.44 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  36.7 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  37.12 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  38.57 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 420 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  37.94 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.84 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.58 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  38.85 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 		 479 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.47 
 
 		 391 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  35.35 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  37.94 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 		 397 aa  266  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.33 
 
 		 386 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  34.42 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  37.56 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  40.41 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  34.42 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  39.04 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  38.35 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.74 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.74 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 453 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 454 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 454 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.28 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  38.69 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  37.07 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.27 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.27 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.24 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  34.1 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  39.09 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 		 386 aa  259  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  38.37 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  36.78 
 
 		 419 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.89 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.4 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  38.94 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0858  acetylornithine aminotransferase  39.11 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  36.15 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.12 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.4 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  40.2 
 
 		 426 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  37.9 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  37.34 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.1 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  36.84 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  37.75 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  38.01 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  36.75 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  39.36 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  37.89 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  35.73 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.98 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  39.21 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  37.22 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.78 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>