More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2159 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 445 aa  924    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  82.7 
 
 		 445 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  82.7 
 
 		 445 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  49.89 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  48.95 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  48.51 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  39.35 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  36.81 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  40.24 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.42 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  35.34 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.67 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  37.47 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 478 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  39.66 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  36.74 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 468 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.01 
 
 		 479 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.77 
 
 		 454 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  36.6 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.72 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  36.7 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.48 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 431 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.46 
 
 		 465 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.59 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  35.56 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.87 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.01 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  36.67 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  34.82 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 		 439 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.03 
 
 		 437 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  34.74 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.96 
 
 		 465 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  33.73 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  32.09 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  34.1 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  33.64 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.64 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  33.72 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  32.93 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  32.92 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  34.52 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  33.25 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 		 440 aa  243  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.03 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.9 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  34.63 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  32.59 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  32.58 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  31.71 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  33 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.35 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  32.71 
 
 		 450 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  35.68 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  33.92 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  31.93 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  34.8 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  32.68 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.25 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  30.56 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  30.25 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  32.48 
 
 		 398 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  32.58 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  33.91 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  33.66 
 
 		 451 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 435 aa  236  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  34.67 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>