More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0199 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 453 aa  931    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  66.74 
 
 		 444 aa  618  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  57.76 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  48.95 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  48.72 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  48.72 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.82 
 
 		 461 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  35.32 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  39.36 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  34.61 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  35 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  38.88 
 
 		 448 aa  265  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  33.79 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.95 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  34.63 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.14 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 		 431 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  35.7 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  35.22 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.16 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.75 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.91 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  32.78 
 
 		 425 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  35.53 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 440 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 454 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  35.08 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  34.73 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  33.26 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  33.11 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  32.95 
 
 		 437 aa  246  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  34.1 
 
 		 426 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  32.58 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  34.71 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.91 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  34 
 
 		 421 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  32.48 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  34.58 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  31.72 
 
 		 434 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  32.02 
 
 		 426 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  32.99 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  31.15 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  31.93 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  34.09 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  33 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  35.09 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  31.79 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 		 430 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  32.75 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.92 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.18 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  35.07 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  34.72 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 442 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  34.6 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  32.41 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  32.43 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  32.91 
 
 		 426 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  32.31 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  32.91 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.73 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  31.93 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  34.34 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  31.83 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  31.31 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  33.82 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.1 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 429 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  32.84 
 
 		 432 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 435 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>