More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1743 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  67.77 
 
 
459 aa  644    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  88.81 
 
 
448 aa  784    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  95.53 
 
 
446 aa  852    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  84.53 
 
 
441 aa  778    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
447 aa  902    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  59.63 
 
 
444 aa  534  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  50.97 
 
 
418 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  51.31 
 
 
417 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.73 
 
 
461 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  46.26 
 
 
441 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.17 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  48.05 
 
 
432 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  48.65 
 
 
441 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  45 
 
 
452 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  46.03 
 
 
439 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  43.58 
 
 
465 aa  359  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  42.7 
 
 
465 aa  352  8.999999999999999e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  44.53 
 
 
427 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  43.47 
 
 
428 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  44.52 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  39.64 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  39.64 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  44.1 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.47 
 
 
479 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  39.47 
 
 
478 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  39.87 
 
 
454 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  39.64 
 
 
454 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  42.19 
 
 
441 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.69 
 
 
468 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  39.87 
 
 
454 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  44.96 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  39.11 
 
 
454 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  39.2 
 
 
454 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  43.2 
 
 
447 aa  308  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  41.51 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.5 
 
 
445 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  41.38 
 
 
440 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  38.17 
 
 
454 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
446 aa  300  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 
445 aa  299  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 
445 aa  299  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 
419 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  42.52 
 
 
439 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 
445 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  41.31 
 
 
430 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  41.08 
 
 
444 aa  293  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  41.38 
 
 
453 aa  292  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  37.1 
 
 
440 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  38.66 
 
 
419 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  38.92 
 
 
445 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  41.31 
 
 
442 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  40.48 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  43.07 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  39.41 
 
 
446 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.91 
 
 
436 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  42.2 
 
 
421 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
427 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  41.23 
 
 
429 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 
432 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  40.94 
 
 
453 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 
446 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  41.5 
 
 
421 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 
446 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 
446 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  39.66 
 
 
430 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  40.36 
 
 
430 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  42.93 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  41.83 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.49 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 
420 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  40.23 
 
 
403 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
427 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  37.92 
 
 
450 aa  273  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
427 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.7 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  39.47 
 
 
427 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  38.54 
 
 
430 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  39.34 
 
 
442 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 
446 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  36.32 
 
 
450 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.49 
 
 
427 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  41.02 
 
 
435 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  42.78 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  41.13 
 
 
426 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.08 
 
 
395 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  41.67 
 
 
427 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  39.4 
 
 
438 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  42.07 
 
 
429 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  39.51 
 
 
419 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
426 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  36.24 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  36.46 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  40.87 
 
 
434 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  42.46 
 
 
427 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  40.64 
 
 
448 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>