More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1957 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 427 aa  876    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  62.26 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  48.18 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  45.88 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  46.35 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  44.39 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  46.21 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  44.25 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  43.86 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  44.81 
 
 		 448 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  41.69 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  43.37 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  41.31 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.94 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  42.4 
 
 		 425 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  41.12 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  44.58 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  41.18 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.56 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  44.53 
 
 		 447 aa  325  9e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  38.12 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  38.12 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  42.57 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  38.12 
 
 		 454 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  44.99 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 478 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  43.12 
 
 		 446 aa  319  6e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 454 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 454 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 468 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 454 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 479 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  40.76 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  42.3 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  42.51 
 
 		 432 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  42.12 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  40.68 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  42.48 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  37.56 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  40.44 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  40.79 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  42.49 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  40.71 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  43.69 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  41.92 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  41.84 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  43.83 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  42.65 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  42.27 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  42.07 
 
 		 426 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  43.89 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.71 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  42.13 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  42.05 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  40.9 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.65 
 
 		 427 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.66 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.9 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.22 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.9 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  42.57 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  44.12 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.9 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  41.3 
 
 		 445 aa  303  5.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  40.24 
 
 		 453 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  40.79 
 
 		 471 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  39.91 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.91 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.34 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.34 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  39.72 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.34 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  38.59 
 
 		 440 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  42.2 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.62 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  40.29 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  40.35 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  40.35 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  40.35 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  40.35 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  40.35 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  40.25 
 
 		 421 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  41.03 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  41.05 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  40.35 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  38.35 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  42.52 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  40.35 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  39.1 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  40.25 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  39.62 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  38.35 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  39.06 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>