More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  100 
 
 		 419 aa  852    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  84.82 
 
 		 417 aa  700    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  70.83 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  67.16 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  68.97 
 
 		 443 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  58.98 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  57.07 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  55.5 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  50.35 
 
 		 442 aa  428  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  48.72 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  51.24 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  47.98 
 
 		 479 aa  365  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  44.25 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  42.54 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  43.41 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  43.26 
 
 		 476 aa  333  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.71 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.36 
 
 		 461 aa  328  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  41.44 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 468 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 454 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  43.43 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  41.44 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  42.57 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  39.6 
 
 		 454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  42.28 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.06 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  38.57 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  42.28 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  42.96 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  41.82 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 		 427 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  42.65 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  44.9 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.08 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  41.98 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  41.98 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  40.48 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 		 434 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.22 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.22 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.33 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.22 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  38.54 
 
 		 448 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  39.46 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  42.12 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  40.35 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  41.98 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  40.15 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  41.03 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  41.05 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  39.71 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  39.71 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  39.71 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  41.34 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  42.86 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  39.01 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  39.01 
 
 		 427 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  38.96 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  41.71 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  40.55 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.87 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  41.63 
 
 		 439 aa  295  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  37.65 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.19 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  39.75 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  40.98 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  39.65 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  39.75 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  39.65 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  39.65 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  39.65 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  39.65 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  39.65 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  43.22 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>