More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1916 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  100 
 
 		 417 aa  850    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  84.82 
 
 		 419 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  69.12 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  66.91 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  67.3 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  61.11 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  58.7 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  55.75 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  49.3 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  49.53 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  51.49 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  46.56 
 
 		 479 aa  359  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  42.34 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  44.08 
 
 		 476 aa  342  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  42.3 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 468 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 454 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  43.14 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  41.16 
 
 		 444 aa  324  1e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  40.59 
 
 		 454 aa  322  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  41.82 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  41.63 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  41.54 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  42.62 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  41.69 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  44.28 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  41.53 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.06 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.95 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  37.77 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  42.27 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  40.33 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  38.63 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  41.38 
 
 		 448 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  38.63 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  38.63 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.65 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  40.65 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.67 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  41.46 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.4 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.4 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.85 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 427 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.4 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  40.44 
 
 		 430 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  41.29 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  37.06 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  39.65 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  41.29 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  39.42 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  40.44 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  39.27 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  39.27 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  39.45 
 
 		 421 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  39.19 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  40.95 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  38.86 
 
 		 430 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  41.1 
 
 		 425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  37.81 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  40.43 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  40.84 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  38.48 
 
 		 426 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  38.2 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  38.2 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  38.2 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  37.13 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.18 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  40.72 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  39.69 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  38.65 
 
 		 426 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1335  4-aminobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  37.07 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  40.15 
 
 		 421 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.4 
 
 		 440 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  39.53 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  37.56 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  38.88 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  38.4 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>