More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0989 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 458 aa  937    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  55.88 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  48.12 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.78 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  46.78 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  47.46 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  46.9 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  46.01 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  48.34 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  46.49 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  48.79 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  41.76 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  43.05 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  44.79 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  44.03 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  43.94 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  42.26 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  42.67 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  41.56 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  40.92 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  43.06 
 
 		 419 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  43.14 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  38.33 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  43.64 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  41.32 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.44 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  43.06 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  43.16 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  42.48 
 
 		 445 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  42.62 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  42.4 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  42.21 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  42.99 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  42.04 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  42.13 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  41.59 
 
 		 419 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  39.59 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  38.1 
 
 		 446 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.87 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  37.05 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  40.86 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  43.61 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  37.78 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  37.28 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  43.14 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  41.05 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  41.18 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.77 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  40.5 
 
 		 439 aa  282  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  38.6 
 
 		 445 aa  282  8.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.53 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.77 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.81 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.77 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.57 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  41.01 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  35.16 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  38.86 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  39.09 
 
 		 434 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.81 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  38.15 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  40.43 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  38.86 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  34.02 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  39.39 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  35.75 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  39.58 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  40.65 
 
 		 427 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  37.59 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  39.95 
 
 		 427 aa  276  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 427 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.04 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  39.43 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.3 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  34.59 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  41.53 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  40.24 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  39.95 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  39.95 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  39.95 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  39.95 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  40.05 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  39.95 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  39.95 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 399 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>