More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2930 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  100 
 
 
460 aa  934    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  71.92 
 
 
462 aa  661    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  89.78 
 
 
460 aa  827    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  62.69 
 
 
452 aa  592  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  41.18 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.62 
 
 
493 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  38.99 
 
 
440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  40.09 
 
 
464 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  41.77 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  37.7 
 
 
540 aa  316  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  37.56 
 
 
963 aa  316  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.55 
 
 
967 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  39.47 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4223  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  39.14 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  37.33 
 
 
958 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  36.7 
 
 
961 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.21 
 
 
473 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.25 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3548  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.03 
 
 
488 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.21 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2287  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.78 
 
 
474 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.37 
 
 
470 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
428 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.14 
 
 
462 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6164  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.59 
 
 
455 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  37.88 
 
 
444 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3790  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.95 
 
 
463 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.755315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.41 
 
 
465 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  36.24 
 
 
452 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.36 
 
 
450 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.36 
 
 
450 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.36 
 
 
450 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.36 
 
 
450 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.36 
 
 
450 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.36 
 
 
450 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.23 
 
 
468 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  39.46 
 
 
427 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0532  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.36 
 
 
450 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.301998  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.87 
 
 
456 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  39.5 
 
 
439 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.3 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  37.28 
 
 
458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.84 
 
 
927 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.61 
 
 
927 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.61 
 
 
927 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.61 
 
 
927 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.61 
 
 
927 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.61 
 
 
927 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.61 
 
 
927 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  35.91 
 
 
459 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  38.41 
 
 
444 aa  280  6e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.59 
 
 
460 aa  279  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.29 
 
 
461 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.86 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.84 
 
 
460 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4220  aminotransferase  37.87 
 
 
469 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.99 
 
 
460 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1806  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.44 
 
 
484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000212834  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.04 
 
 
454 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  37.95 
 
 
432 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.14 
 
 
458 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.26 
 
 
464 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  37.47 
 
 
441 aa  266  7e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  34.38 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  35.36 
 
 
461 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  36.46 
 
 
447 aa  265  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  36.9 
 
 
456 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  36.68 
 
 
419 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
478 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
454 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.3 
 
 
432 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
454 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  35.23 
 
 
479 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 
454 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 
454 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 
468 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  36.22 
 
 
448 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  38.02 
 
 
418 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  36.28 
 
 
446 aa  258  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  35.31 
 
 
468 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  37.07 
 
 
450 aa  257  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.78 
 
 
465 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35 
 
 
454 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  36.91 
 
 
453 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  34.14 
 
 
471 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  33.94 
 
 
453 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2088  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.48 
 
 
429 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  36.28 
 
 
443 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.08 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  35.45 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  36.02 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  37.41 
 
 
427 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  37.22 
 
 
403 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0354  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.08 
 
 
430 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244912  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  36.26 
 
 
448 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  36.07 
 
 
419 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>