More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0564 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  100 
 
 		 461 aa  929    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  41.28 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  37.47 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.89 
 
 		 428 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.44 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  36.98 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  38.88 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.67 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.99 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 		 448 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.97 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  37.79 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  35.36 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  38.06 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  38.06 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  38.06 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  37.31 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  35.46 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.79 
 
 		 967 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.53 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.54 
 
 		 439 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 		 454 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  37.77 
 
 		 448 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 		 454 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  35.65 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 474 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.94 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.16 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.17 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  34.25 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.16 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.16 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  37.14 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.12 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.02 
 
 		 454 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  35.46 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  38.74 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.53 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.74 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  34.73 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3548  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.65 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.21 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  36.32 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4223  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.61 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  36.48 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.41 
 
 		 958 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  35.1 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  38.41 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  35.4 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.46 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3790  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.3 
 
 		 463 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  33.85 
 
 		 459 aa  250  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  35.71 
 
 		 963 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  36.17 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.71 
 
 		 464 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.82 
 
 		 473 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.06 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  36.42 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  31.64 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  36.34 
 
 		 961 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  32.1 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.35 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  35.19 
 
 		 427 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 		 440 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  34.37 
 
 		 435 aa  246  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.5 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  34.17 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.44 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  35.65 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  36.97 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  38.57 
 
 		 420 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 		 452 aa  243  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2818  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  33.49 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.44 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  37.11 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.1 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  36.32 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  35.79 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  35.39 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2542  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.36 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00207797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.44 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.07 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.44 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.44 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  37.01 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.44 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.44 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  36.25 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  36.93 
 
 		 540 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>