More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0510 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  67.33 
 
 		 459 aa  641    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  85.14 
 
 		 446 aa  775    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  85.36 
 
 		 448 aa  743    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 441 aa  889    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  84.53 
 
 		 447 aa  778    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  62.56 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  52.96 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  51.08 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  48.41 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  49.4 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  46.92 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  47.99 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  44.34 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  44.93 
 
 		 465 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  44.57 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  44.47 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  44.03 
 
 		 458 aa  340  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  44.99 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  43.13 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  43.61 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  44.92 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  40.37 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  40.37 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  38.53 
 
 		 478 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  38.31 
 
 		 479 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  39.91 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  38.31 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  39.91 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  41.71 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  39.44 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  38.98 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  40.33 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.9 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  42.33 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  40.24 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  41.94 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  40.98 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  40.89 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  37.39 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  38.06 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  41.19 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  43.41 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  41.55 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  40.55 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  42.72 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  43.69 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  41.07 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  38.82 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  40.59 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  38.27 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  43.22 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.4 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.4 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.4 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.67 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  38.26 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  40.29 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  42.09 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  40.48 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  41.67 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.86 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  39.95 
 
 		 442 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  41.92 
 
 		 427 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  42.11 
 
 		 421 aa  275  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  41.92 
 
 		 429 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  41.92 
 
 		 429 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  43.07 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.56 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  41.81 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  40.8 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  43.07 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  38.93 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 419 aa  273  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  41.41 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  40.19 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  40.61 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  41.16 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  38.25 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  37.05 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  37.99 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  41.45 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  37.47 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  38.93 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  38.26 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  40.99 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  40.37 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  39.51 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  39.76 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  41.36 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>