More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0759 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  85.14 
 
 
441 aa  775    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  87.92 
 
 
448 aa  770    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
446 aa  897    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  95.53 
 
 
447 aa  852    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  66.37 
 
 
459 aa  629  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  58.72 
 
 
444 aa  528  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  50.12 
 
 
418 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  50.6 
 
 
417 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.96 
 
 
461 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  48.17 
 
 
432 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  45.89 
 
 
441 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  47.49 
 
 
431 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  48.31 
 
 
441 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  45.1 
 
 
452 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  45.33 
 
 
439 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  43.68 
 
 
465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  43.24 
 
 
465 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  41.56 
 
 
458 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  43.12 
 
 
427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  43.13 
 
 
428 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  44.1 
 
 
471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 
454 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 
454 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  39.21 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 
454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  43.57 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.21 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  41.49 
 
 
441 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  40.23 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  41.74 
 
 
448 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  42.45 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.5 
 
 
445 aa  300  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  38.58 
 
 
454 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  43.22 
 
 
439 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  42.02 
 
 
440 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  39.66 
 
 
445 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  38.23 
 
 
445 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  38.23 
 
 
445 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  40.34 
 
 
419 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  38.36 
 
 
446 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  41.11 
 
 
453 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  41.59 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 
445 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  40.63 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  38.78 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  41.75 
 
 
442 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.76 
 
 
438 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  39.36 
 
 
453 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.07 
 
 
436 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  41.23 
 
 
429 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  37.8 
 
 
419 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  41.43 
 
 
421 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  40.76 
 
 
432 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.49 
 
 
427 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 
446 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 
446 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 
446 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  35.99 
 
 
440 aa  274  3e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
429 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
429 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  42 
 
 
428 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  41.75 
 
 
421 aa  273  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
427 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.67 
 
 
420 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 
446 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  37.38 
 
 
450 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  40.36 
 
 
430 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  39.41 
 
 
430 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
403 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.49 
 
 
427 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  42.68 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.22 
 
 
390 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  39.23 
 
 
430 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  39.23 
 
 
427 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  41.32 
 
 
435 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 
421 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 
427 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.33 
 
 
422 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  35.94 
 
 
450 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  41.23 
 
 
426 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.37 
 
 
395 aa  266  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  41.92 
 
 
429 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  39.06 
 
 
442 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  41.67 
 
 
427 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 
427 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  38.6 
 
 
421 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  38.6 
 
 
421 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  38.6 
 
 
421 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  38.6 
 
 
421 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  39.1 
 
 
425 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  38.6 
 
 
421 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  41.41 
 
 
436 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>