More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3784 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  70.32 
 
 
462 aa  646    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  100 
 
 
460 aa  932    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  89.78 
 
 
460 aa  849    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  62.25 
 
 
452 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  39.55 
 
 
457 aa  340  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  39.82 
 
 
440 aa  328  9e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.83 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  37.62 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.7 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  36.38 
 
 
963 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.92 
 
 
469 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.17 
 
 
958 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.51 
 
 
967 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.24 
 
 
469 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2287  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.78 
 
 
474 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139987  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  39.47 
 
 
456 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4223  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 
452 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.04 
 
 
470 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3548  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 
463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.37 
 
 
473 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.85 
 
 
488 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.05 
 
 
463 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  35.98 
 
 
961 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  37.5 
 
 
444 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  39.14 
 
 
439 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.41 
 
 
428 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.05 
 
 
465 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.63 
 
 
470 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6164  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.23 
 
 
455 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.67 
 
 
452 aa  289  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3790  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.97 
 
 
463 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.755315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.15 
 
 
458 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.87 
 
 
450 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 
450 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0532  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.87 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.301998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.55 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.4 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.47 
 
 
462 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.66 
 
 
456 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 
427 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.15 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 
459 aa  274  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1806  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.5 
 
 
484 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000212834  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 
447 aa  272  7e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.42 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.83 
 
 
927 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.59 
 
 
927 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.59 
 
 
927 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.59 
 
 
927 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.59 
 
 
927 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  37.59 
 
 
927 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.04 
 
 
444 aa  272  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.59 
 
 
927 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.28 
 
 
461 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.63 
 
 
431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  36.76 
 
 
441 aa  269  7e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  36.03 
 
 
446 aa  263  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.81 
 
 
464 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.08 
 
 
478 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.95 
 
 
460 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 
454 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34 
 
 
454 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.15 
 
 
454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  33.92 
 
 
468 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 
454 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 
454 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.5 
 
 
460 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.55 
 
 
479 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.17 
 
 
454 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
458 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  34.17 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.35 
 
 
465 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  33.41 
 
 
442 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0354  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.18 
 
 
430 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244912  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.17 
 
 
436 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4220  aminotransferase  35.42 
 
 
469 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.15 
 
 
448 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  35.91 
 
 
432 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  35.88 
 
 
419 aa  249  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.9 
 
 
441 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1038  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.26 
 
 
446 aa  249  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.54 
 
 
418 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  36.98 
 
 
448 aa  247  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  35.51 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  36 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  36 
 
 
446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  35.37 
 
 
432 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  35.54 
 
 
456 aa  246  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2088  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.78 
 
 
429 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  33.55 
 
 
461 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  37.22 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  36.43 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  32.97 
 
 
471 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>