More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0220 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  100 
 
 		 436 aa  871    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  53.12 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  51.17 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  51.51 
 
 		 443 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  51.41 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  50.82 
 
 		 429 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  49.3 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  48.6 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  48.02 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  50.35 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  50.58 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  44.76 
 
 		 437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  46.02 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  40.24 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  38.66 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.53 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  39 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  36.6 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  36.28 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  37.16 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  38.1 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.93 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.23 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  34.67 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  36.36 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 445 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  41.01 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  40.67 
 
 		 441 aa  247  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.17 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  36.55 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  40.96 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.61 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  36.34 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  37.75 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.3 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  38.26 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  35.32 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  37.16 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.88 
 
 		 427 aa  239  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  34.7 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.02 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  36.08 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  35.45 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.85 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  37.47 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  33.88 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  35.98 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  35.9 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.14 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1023 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1049 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.03 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.77 
 
 		 432 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  37.76 
 
 		 422 aa  236  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  36.85 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.56 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  37.05 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  36.78 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.68 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.21 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  34.47 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  36.99 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  34.79 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  37.62 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  35.67 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  34.56 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  33.89 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  34.99 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 448 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  35.33 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  34.92 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  33.81 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  35.86 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  34.91 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  33.89 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.18 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  36.81 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>