More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2054 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 403 aa  799    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  70.9 
 
 		 402 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.06 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.42 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.34 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.94 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  59.69 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  57.54 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  56.92 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.25 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  56.81 
 
 		 395 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.39 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  55.16 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.95 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.94 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  53.94 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  54.9 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  55.33 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  54.9 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.59 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  53.79 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  54.52 
 
 		 387 aa  352  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  51.41 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.62 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  51.41 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.94 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  50.25 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  56.64 
 
 		 429 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  49.13 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 		 394 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  51.05 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  55.9 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  57.45 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.28 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.86 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.9 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.35 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.45 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.97 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.51 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.84 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  48.31 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.68 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.54 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.7 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.38 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.95 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  42.36 
 
 		 431 aa  305  7e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.1 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.56 
 
 		 395 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.52 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.54 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.03 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.83 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.48 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.27 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.07 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.44 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.7 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.7 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  46.48 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.21 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.43 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.64 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.39 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 		 398 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 		 398 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.95 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  44.92 
 
 		 410 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  47.53 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  43.8 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.03 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.78 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.24 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  43.29 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  44.74 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.32 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.47 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.59 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.8 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  40.92 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  43.96 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>