More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  794    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  74.22 
 
 		 387 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.43 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  62.34 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  62.6 
 
 		 390 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.3 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.93 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  61.2 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  61.2 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  61.2 
 
 		 402 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  61.14 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  57.14 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.97 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  56.67 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.18 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  65.12 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.89 
 
 		 399 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  65.94 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.36 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  56.02 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.18 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.01 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.94 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  53.65 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  53.65 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  53.2 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  53.79 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.45 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  51.26 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  57.4 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.26 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.65 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  50.49 
 
 		 428 aa  345  5e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  49.22 
 
 		 392 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.03 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.64 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.19 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.49 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  43.99 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 		 395 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.21 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.71 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.09 
 
 		 402 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  44.58 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.07 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.8 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.61 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.92 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  45.17 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.18 
 
 		 406 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.92 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.75 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.42 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  46.15 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.94 
 
 		 406 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.78 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.94 
 
 		 398 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.42 
 
 		 400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.81 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  47.09 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.68 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  43.77 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 		 399 aa  308  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  43.85 
 
 		 400 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 		 418 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  43.34 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.59 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 385 aa  307  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.03 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.33 
 
 		 401 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.04 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  45.66 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.46 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.02 
 
 		 391 aa  299  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  41.82 
 
 		 397 aa  298  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.97 
 
 		 393 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  43.93 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.17 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>