More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1891 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
429 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  89.04 
 
 
429 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  64.68 
 
 
390 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  64.4 
 
 
395 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.68 
 
 
393 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  66.41 
 
 
400 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  63.04 
 
 
402 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  63.04 
 
 
402 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  62.18 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.27 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  64.74 
 
 
395 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.35 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  65.62 
 
 
387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.21 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.53 
 
 
416 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.08 
 
 
399 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  60.78 
 
 
444 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  57.39 
 
 
414 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.44 
 
 
401 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.62 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.62 
 
 
401 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.07 
 
 
400 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  56.14 
 
 
399 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  61.38 
 
 
411 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  56.22 
 
 
419 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  55.7 
 
 
403 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  54.64 
 
 
423 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.79 
 
 
420 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  53.62 
 
 
426 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.69 
 
 
402 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  54.48 
 
 
425 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.55 
 
 
425 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.71 
 
 
430 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  50.93 
 
 
428 aa  339  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
398 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
398 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.99 
 
 
398 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.47 
 
 
442 aa  322  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.14 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
394 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.64 
 
 
403 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.51 
 
 
394 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.76 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.01 
 
 
401 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
395 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.64 
 
 
397 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.75 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  44.63 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  47.75 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.38 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.33 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.97 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.14 
 
 
400 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.93 
 
 
356 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  44.44 
 
 
400 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  41.07 
 
 
397 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.33 
 
 
397 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.48 
 
 
417 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
391 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.78 
 
 
398 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 
396 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 
402 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.51 
 
 
388 aa  299  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
400 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.16 
 
 
395 aa  299  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
399 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.43 
 
 
412 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.72 
 
 
375 aa  297  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.15 
 
 
385 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
394 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.15 
 
 
385 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.97 
 
 
396 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 
392 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.84 
 
 
398 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.64 
 
 
406 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1628  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.48 
 
 
405 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.13 
 
 
406 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.13 
 
 
406 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 
390 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.58 
 
 
406 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.07 
 
 
380 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
396 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1054  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.51 
 
 
405 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.11 
 
 
399 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.11 
 
 
399 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.69 
 
 
396 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
410 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.3 
 
 
396 aa  287  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.97 
 
 
406 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.77 
 
 
406 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.12 
 
 
387 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.82 
 
 
405 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.42 
 
 
413 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.31 
 
 
403 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>