More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3708 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  79.8 
 
 		 410 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 		 412 aa  828    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.99 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  60.57 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  57.87 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.38 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  60.79 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  59.07 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  56.15 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  57.62 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  53.85 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  58.27 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  59.11 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  58.14 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.92 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.14 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  53.08 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.3 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  51.65 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  51.45 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  51.19 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  51.56 
 
 		 391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  48.57 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  51.26 
 
 		 410 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  50.38 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  47.84 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  49.61 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  48.61 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  48.61 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  48.35 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  48.69 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  47.69 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  47.67 
 
 		 404 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  54.86 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.92 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.23 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.93 
 
 		 391 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.97 
 
 		 394 aa  343  5e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.59 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  41.69 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.51 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.81 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.36 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.43 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.42 
 
 		 418 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.16 
 
 		 390 aa  328  9e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  42.24 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  42.46 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.73 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.83 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.88 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  42.07 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  41.65 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.48 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  47.33 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.71 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.97 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.11 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  41.41 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  47.49 
 
 		 405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.48 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.15 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.97 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.72 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 427 aa  315  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.53 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.73 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  44.14 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.96 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  43.97 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.61 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.06 
 
 		 387 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.14 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  41.48 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  46.25 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  45.73 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.51 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>