More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0638 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  77.78 
 
 
397 aa  656    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
397 aa  821    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  72.91 
 
 
405 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  72.45 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0609  acetylornithine aminotransferase  72.19 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.110616  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  70.92 
 
 
398 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  70.41 
 
 
401 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 
394 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
395 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40.93 
 
 
396 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.75 
 
 
394 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.86 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 
394 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.34 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
388 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
426 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.8 
 
 
400 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.52 
 
 
399 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.72 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.1 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  39.63 
 
 
402 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  40.93 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.04 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.12 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 
399 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
399 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  41.99 
 
 
394 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  41.99 
 
 
394 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 
398 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 
399 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.6 
 
 
396 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.69 
 
 
385 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.34 
 
 
399 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
396 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  40.58 
 
 
396 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.39 
 
 
398 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 
390 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.84 
 
 
399 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 
385 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 
385 aa  292  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  39.68 
 
 
389 aa  292  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  39.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
399 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  40.59 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  39.36 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  40.63 
 
 
388 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.63 
 
 
388 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.38 
 
 
410 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 
390 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.05 
 
 
397 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 
403 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.27 
 
 
399 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  39.27 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  39.27 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  41.33 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  38.67 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.87 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  40.53 
 
 
393 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.36 
 
 
396 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  36.5 
 
 
397 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.43 
 
 
396 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.36 
 
 
406 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.87 
 
 
406 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 
404 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  38.36 
 
 
406 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.35 
 
 
389 aa  279  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  38.36 
 
 
406 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
395 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.36 
 
 
406 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
410 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.36 
 
 
406 aa  278  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.36 
 
 
406 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  37.04 
 
 
402 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  39.68 
 
 
398 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.36 
 
 
406 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  38.5 
 
 
395 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  37.43 
 
 
391 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  38.74 
 
 
396 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
394 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  37.6 
 
 
390 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  36.39 
 
 
399 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  36.99 
 
 
400 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 
436 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 
400 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  37.67 
 
 
393 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  38.56 
 
 
396 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
402 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>