More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0626 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
426 aa  867    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
395 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.33 
 
 
396 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  44.86 
 
 
395 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.87 
 
 
398 aa  362  8e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.61 
 
 
395 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
395 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.11 
 
 
399 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
403 aa  345  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
402 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.43 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
396 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.98 
 
 
396 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
397 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.25 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.13 
 
 
399 aa  338  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.16 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.68 
 
 
399 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  42.17 
 
 
400 aa  332  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.27 
 
 
399 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.36 
 
 
399 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 
385 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.31 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
387 aa  328  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  41.39 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.25 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  42.05 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 
394 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.51 
 
 
400 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.3 
 
 
396 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
398 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
417 aa  322  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.03 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  42.05 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
397 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40 
 
 
396 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
380 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  39.39 
 
 
400 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.12 
 
 
397 aa  315  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  41.79 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  41.35 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  41.13 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.78 
 
 
406 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
391 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  41.51 
 
 
406 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
385 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  41.51 
 
 
406 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.51 
 
 
406 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.51 
 
 
406 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.24 
 
 
400 aa  308  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.51 
 
 
406 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0609  acetylornithine aminotransferase  41.09 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.110616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  39.7 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
392 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.51 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.51 
 
 
406 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  41.65 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.99 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.77 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  40.25 
 
 
404 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.09 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.45 
 
 
406 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.99 
 
 
406 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  40.41 
 
 
397 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
388 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
392 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
388 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.12 
 
 
427 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.77 
 
 
406 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
411 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.16 
 
 
410 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.85 
 
 
411 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.6 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.77 
 
 
406 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.29 
 
 
409 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41 
 
 
413 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.44 
 
 
408 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  39.55 
 
 
400 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.35 
 
 
410 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.1 
 
 
410 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.6 
 
 
410 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
398 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
410 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  41.18 
 
 
402 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
398 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.61 
 
 
401 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  39.75 
 
 
404 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.01 
 
 
406 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>