More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0545 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  100 
 
 
396 aa  815    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  91.39 
 
 
396 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  91.39 
 
 
396 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  72.22 
 
 
398 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  72.66 
 
 
399 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  568  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  67.42 
 
 
396 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  67.42 
 
 
396 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  67.68 
 
 
396 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  66.92 
 
 
396 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  67.42 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  66.92 
 
 
403 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  64.3 
 
 
398 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  60.36 
 
 
402 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  56.81 
 
 
394 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  56.81 
 
 
394 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  59.25 
 
 
402 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  57.32 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  57.14 
 
 
409 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  54.73 
 
 
399 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  53.2 
 
 
415 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  52.13 
 
 
399 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  50.75 
 
 
407 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  51.63 
 
 
399 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  50.76 
 
 
427 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  51.69 
 
 
396 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  50.64 
 
 
408 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  53.2 
 
 
405 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  51.02 
 
 
404 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  53.71 
 
 
411 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  50.39 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  54.22 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  52.24 
 
 
409 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  51.41 
 
 
408 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  49.88 
 
 
452 aa  410  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  50 
 
 
401 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  49.49 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  49.49 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  49.49 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  49.37 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  49.27 
 
 
454 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  48.97 
 
 
404 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  51.56 
 
 
680 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  49.01 
 
 
420 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  52.73 
 
 
410 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  48.74 
 
 
409 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  48.12 
 
 
406 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  48.37 
 
 
403 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  48.73 
 
 
410 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  49.1 
 
 
404 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  49.26 
 
 
448 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  51.5 
 
 
417 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  48.1 
 
 
415 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  48.07 
 
 
413 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  47.83 
 
 
424 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  46.6 
 
 
412 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  51.79 
 
 
412 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  48.98 
 
 
416 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  50.38 
 
 
414 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  48.47 
 
 
404 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  47.65 
 
 
410 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  45.52 
 
 
408 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  48.02 
 
 
435 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  49.88 
 
 
425 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  45.91 
 
 
417 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  45.84 
 
 
418 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  45.71 
 
 
406 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  44.92 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.94 
 
 
395 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
395 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.68 
 
 
395 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.64 
 
 
396 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.18 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  40.91 
 
 
398 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.99 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.95 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
394 aa  302  8.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 
402 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 
399 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 
403 aa  296  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.81 
 
 
400 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  39.65 
 
 
396 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.53 
 
 
396 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  39.09 
 
 
396 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  40.32 
 
 
401 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
397 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 
397 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.31 
 
 
402 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.18 
 
 
399 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  39.58 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.96 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>