More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0734 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  76.31 
 
 
401 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  78.34 
 
 
398 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
405 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0609  acetylornithine aminotransferase  75.31 
 
 
399 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.110616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  74.81 
 
 
399 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  72.91 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  69.9 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.08 
 
 
395 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
395 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.64 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.15 
 
 
402 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.84 
 
 
400 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
394 aa  319  7e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
396 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  39.31 
 
 
396 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.04 
 
 
399 aa  315  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
426 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.9 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.69 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.76 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.88 
 
 
385 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.12 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.64 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
399 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  38.66 
 
 
398 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.24 
 
 
397 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
399 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
397 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  40.58 
 
 
391 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
387 aa  295  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  38.8 
 
 
390 aa  295  9e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
387 aa  292  7e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.63 
 
 
399 aa  292  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  40.53 
 
 
395 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.11 
 
 
404 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.47 
 
 
396 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  40.16 
 
 
393 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.43 
 
 
388 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  39.11 
 
 
396 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  40.43 
 
 
388 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
396 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
400 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 
402 aa  289  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 
400 aa  289  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
410 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.79 
 
 
399 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.44 
 
 
417 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
398 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  39.51 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  38.56 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
392 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  38.99 
 
 
396 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  39.36 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  39.24 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.22 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.36 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  39.08 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  41.55 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.2 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  37.4 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  39.57 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  39.04 
 
 
390 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  39.18 
 
 
401 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
405 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 
402 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.26 
 
 
403 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
404 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  38.89 
 
 
400 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  39.36 
 
 
391 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
405 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  36.13 
 
 
397 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 
397 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 
391 aa  279  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  38.25 
 
 
393 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 
397 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.62 
 
 
403 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  41.47 
 
 
394 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  38.73 
 
 
404 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.98 
 
 
402 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  38.58 
 
 
394 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  38.58 
 
 
394 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  39.63 
 
 
393 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  38.6 
 
 
404 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  36.48 
 
 
396 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  36.48 
 
 
396 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 
398 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 
398 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
380 aa  276  7e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.86 
 
 
398 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  35.31 
 
 
395 aa  275  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.86 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>