More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1957 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
399 aa  823    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0609  acetylornithine aminotransferase  75.82 
 
 
399 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.110616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  74.81 
 
 
405 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  73.8 
 
 
398 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  71.18 
 
 
401 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  72.45 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  70.41 
 
 
397 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
394 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
395 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
395 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.16 
 
 
395 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
395 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.57 
 
 
394 aa  319  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
396 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.36 
 
 
388 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.33 
 
 
387 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.15 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
385 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.86 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.36 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
426 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.41 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 
385 aa  305  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
403 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.25 
 
 
394 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.61 
 
 
400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.34 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  41.16 
 
 
400 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
391 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 
399 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
392 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.52 
 
 
417 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
396 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
398 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.43 
 
 
396 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 
404 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  41.13 
 
 
399 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
396 aa  292  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
388 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
402 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.37 
 
 
396 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
388 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 
397 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.98 
 
 
398 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  40.52 
 
 
401 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
390 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
398 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.18 
 
 
400 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  38.77 
 
 
401 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
397 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.89 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  41.07 
 
 
393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
399 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  41.84 
 
 
394 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
402 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.63 
 
 
404 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  40.27 
 
 
390 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
405 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
405 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  38.5 
 
 
390 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  40.96 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
390 aa  285  7e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  41.07 
 
 
395 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  40.96 
 
 
396 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.47 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  38.8 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  39.26 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  40.44 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
410 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.32 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
397 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  39.24 
 
 
397 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
397 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  39.73 
 
 
393 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  38.93 
 
 
404 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  38.1 
 
 
399 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  39.58 
 
 
400 aa  279  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.05 
 
 
393 aa  279  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  36.03 
 
 
403 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  36.03 
 
 
403 aa  278  9e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.86 
 
 
399 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  36.18 
 
 
403 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  38.97 
 
 
402 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 
403 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  40.48 
 
 
396 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
393 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  39.2 
 
 
391 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
410 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  40.83 
 
 
399 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
389 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.92 
 
 
405 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>