More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3572 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  88.56 
 
 
404 aa  743    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  80.15 
 
 
398 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  77.58 
 
 
402 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  81.09 
 
 
402 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  79.61 
 
 
404 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
404 aa  819    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  74.87 
 
 
398 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  73.16 
 
 
400 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  75.7 
 
 
410 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  71.57 
 
 
398 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  71.32 
 
 
398 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  59.07 
 
 
391 aa  481  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  58.81 
 
 
390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  57.77 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  59.49 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  56.38 
 
 
394 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  54.12 
 
 
394 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  52.99 
 
 
392 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  51.95 
 
 
391 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.33 
 
 
410 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.65 
 
 
399 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.97 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.8 
 
 
398 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.42 
 
 
393 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  51.3 
 
 
388 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
412 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  48.06 
 
 
389 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  48.06 
 
 
389 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
388 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  48.26 
 
 
402 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
388 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  48 
 
 
396 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.11 
 
 
397 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  51.6 
 
 
395 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
396 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  47.86 
 
 
399 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  51.86 
 
 
400 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
399 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  48.35 
 
 
399 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  48.83 
 
 
395 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  50.8 
 
 
400 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
395 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  48.58 
 
 
398 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
396 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.8 
 
 
397 aa  358  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.04 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
396 aa  356  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  46.86 
 
 
403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  46.75 
 
 
400 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
395 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  47.09 
 
 
394 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.45 
 
 
417 aa  350  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
398 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.23 
 
 
396 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.65 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  47.41 
 
 
422 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  43.37 
 
 
418 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  43.58 
 
 
418 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.96 
 
 
394 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
426 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.57 
 
 
399 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
423 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.17 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
427 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  45.1 
 
 
397 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.34 
 
 
395 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
389 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
393 aa  325  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
427 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
434 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
398 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  45 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  45.62 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  44.41 
 
 
401 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.81 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.43 
 
 
418 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
398 aa  318  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
403 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  44.2 
 
 
395 aa  316  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.68 
 
 
396 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  41.93 
 
 
386 aa  315  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  43.39 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.37 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
418 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
403 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
386 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
397 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  46.34 
 
 
405 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
396 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  44.65 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.73 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>