More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  100 
 
 
408 aa  827    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  64.75 
 
 
412 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  67.29 
 
 
404 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  65.68 
 
 
404 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  62.99 
 
 
403 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  62.87 
 
 
427 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  59.9 
 
 
406 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  59.95 
 
 
413 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  63.57 
 
 
407 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  62.24 
 
 
415 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  60 
 
 
416 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  61.8 
 
 
680 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  57.65 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  60.37 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  58.93 
 
 
403 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  57.85 
 
 
424 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  58.48 
 
 
404 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  59.38 
 
 
399 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  57.83 
 
 
418 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  59.06 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  59.06 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  59.06 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  56.93 
 
 
404 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  57.33 
 
 
409 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  59.49 
 
 
406 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  57.87 
 
 
407 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  49.87 
 
 
398 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  51.41 
 
 
403 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  50.89 
 
 
399 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  51.57 
 
 
415 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  53.2 
 
 
411 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  49.62 
 
 
399 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
396 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  47.57 
 
 
396 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
396 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  47.31 
 
 
396 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  50 
 
 
412 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  48.08 
 
 
402 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
396 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  47.57 
 
 
396 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  47.57 
 
 
396 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
396 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  47.31 
 
 
396 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  47.31 
 
 
396 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  47.66 
 
 
399 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  47.56 
 
 
408 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  48.82 
 
 
402 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 
396 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  48.59 
 
 
408 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  45.52 
 
 
396 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  47.09 
 
 
398 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  48.98 
 
 
410 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  50 
 
 
408 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  46.65 
 
 
396 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  46.65 
 
 
396 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  48.29 
 
 
409 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  45.77 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  48.63 
 
 
422 aa  362  9e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  49.87 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  46.93 
 
 
417 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  45.52 
 
 
410 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  44.07 
 
 
394 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  44.07 
 
 
394 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  45.75 
 
 
414 aa  347  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  44.53 
 
 
448 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  45.86 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  41.49 
 
 
452 aa  335  7e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  44.17 
 
 
420 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  41.79 
 
 
409 aa  332  6e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  45.15 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  41.56 
 
 
454 aa  323  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  43.38 
 
 
435 aa  318  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  44.02 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  38.78 
 
 
398 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.71 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.8 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 
395 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  38.3 
 
 
402 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
396 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.7 
 
 
390 aa  242  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  36.99 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.27 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 
395 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  34.11 
 
 
396 aa  239  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.93 
 
 
393 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 
399 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  37.06 
 
 
398 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.06 
 
 
396 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.54 
 
 
401 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
398 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.1 
 
 
394 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  39.26 
 
 
411 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.61 
 
 
403 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.48 
 
 
395 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
398 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.82 
 
 
398 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  35.94 
 
 
394 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.04 
 
 
392 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  37.22 
 
 
398 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>