More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1586 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  100 
 
 
409 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  78.79 
 
 
416 aa  621  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  75 
 
 
404 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  69.07 
 
 
404 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  68.56 
 
 
404 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  66.33 
 
 
427 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  63.73 
 
 
406 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  66.07 
 
 
413 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  66.75 
 
 
399 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  63.36 
 
 
396 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  63.88 
 
 
412 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  61.06 
 
 
403 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  65.05 
 
 
408 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  65.05 
 
 
408 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  65.05 
 
 
408 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  61.6 
 
 
407 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  65.05 
 
 
404 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  61.71 
 
 
680 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  60.96 
 
 
424 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  63.22 
 
 
418 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  62.85 
 
 
403 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  60.95 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  61 
 
 
415 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  54.04 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  63.54 
 
 
406 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  55.28 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  52.14 
 
 
399 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  50.63 
 
 
398 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  57.33 
 
 
408 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  52.41 
 
 
396 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  52.15 
 
 
396 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  52.15 
 
 
396 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  52.41 
 
 
396 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  52.15 
 
 
396 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  51.65 
 
 
398 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  53.52 
 
 
399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  52.41 
 
 
396 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  52.41 
 
 
396 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  62.09 
 
 
407 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  52.26 
 
 
399 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  51.9 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  51.39 
 
 
396 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  51.9 
 
 
396 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  53.4 
 
 
403 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  50.89 
 
 
396 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  54.96 
 
 
412 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  53.59 
 
 
408 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  49.12 
 
 
396 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  49.5 
 
 
402 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  49.12 
 
 
415 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  49.12 
 
 
396 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  53.85 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  55.23 
 
 
408 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  48.74 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  50.63 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  54.19 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  47.97 
 
 
410 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  52.55 
 
 
410 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  46.78 
 
 
409 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  52.55 
 
 
422 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  46.29 
 
 
414 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  45.75 
 
 
417 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  45.09 
 
 
420 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  51.15 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  45.57 
 
 
410 aa  362  9e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  44.25 
 
 
417 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  43.43 
 
 
394 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  43.43 
 
 
394 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  44.58 
 
 
448 aa  353  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  43.22 
 
 
435 aa  350  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  41.83 
 
 
454 aa  342  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  41.81 
 
 
452 aa  338  7e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  43.52 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.73 
 
 
390 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  37.44 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.77 
 
 
400 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  37.78 
 
 
398 aa  272  9e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.16 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.93 
 
 
396 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 
403 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  41 
 
 
396 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.12 
 
 
395 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38.06 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.06 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
401 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
396 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.64 
 
 
399 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.06 
 
 
397 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
444 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  39.66 
 
 
396 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.8 
 
 
399 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  42.07 
 
 
414 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.38 
 
 
396 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  37.12 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  36.78 
 
 
398 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  39.54 
 
 
390 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 
394 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>