More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0609 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  100 
 
 
424 aa  859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  70.33 
 
 
418 aa  591  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  62.44 
 
 
403 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  64.62 
 
 
404 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  63.45 
 
 
401 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  64.77 
 
 
404 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  63.54 
 
 
680 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  62.09 
 
 
407 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  63.93 
 
 
406 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  63.43 
 
 
403 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  64.52 
 
 
412 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  63.87 
 
 
399 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  63.38 
 
 
408 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  63.38 
 
 
408 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  63.38 
 
 
408 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  63.28 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  61.68 
 
 
413 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  61.65 
 
 
416 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  60.55 
 
 
415 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  60.96 
 
 
409 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  59.69 
 
 
404 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  57.85 
 
 
408 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  59.34 
 
 
404 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  57.25 
 
 
396 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  61.76 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  60.3 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  52.94 
 
 
399 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  51.88 
 
 
403 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 
399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  51.44 
 
 
399 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  51.39 
 
 
396 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  51.39 
 
 
396 aa  425  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  51.13 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  51.13 
 
 
396 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  51.39 
 
 
396 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  51.13 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  50.38 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  51.39 
 
 
396 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  49.88 
 
 
402 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  50.63 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  50.63 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  50.88 
 
 
396 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  50.89 
 
 
415 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  49.62 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  49.5 
 
 
410 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  52.2 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  47.62 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  47.45 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  47.45 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
396 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  50.52 
 
 
408 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  47.79 
 
 
414 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  51.89 
 
 
411 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  50.91 
 
 
402 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  49.74 
 
 
408 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  47.85 
 
 
409 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  51.07 
 
 
408 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  46.23 
 
 
417 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  47.34 
 
 
410 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  51.04 
 
 
422 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  46.04 
 
 
425 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  44.53 
 
 
398 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  49.74 
 
 
405 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  44.25 
 
 
409 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  45.89 
 
 
454 aa  364  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  47.17 
 
 
435 aa  364  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  45.04 
 
 
448 aa  363  5.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  44 
 
 
410 aa  355  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  43.38 
 
 
420 aa  348  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  42.09 
 
 
394 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  43.52 
 
 
417 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  42.09 
 
 
394 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  42.86 
 
 
452 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
395 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.59 
 
 
396 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  36.23 
 
 
395 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.6 
 
 
394 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
399 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  35.86 
 
 
400 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  35.81 
 
 
397 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.27 
 
 
396 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.5 
 
 
396 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.59 
 
 
395 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  36.83 
 
 
396 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  38.99 
 
 
397 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  38.24 
 
 
401 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.29 
 
 
385 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  34.44 
 
 
394 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  38.2 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
395 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  35.4 
 
 
397 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  35.82 
 
 
391 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.01 
 
 
402 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.12 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  39.47 
 
 
396 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  36.04 
 
 
418 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  35.66 
 
 
394 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.33 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>