More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0159 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  100 
 
 		 408 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  87.25 
 
 		 408 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  88.48 
 
 		 408 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  54.64 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  52.38 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  60.35 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  58.25 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  52 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  58.5 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  56.82 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  54.09 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  52.7 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  53.73 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  51.41 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  53.2 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  51.41 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  51.16 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  50.64 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  53.45 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  49.74 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  50.39 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  49.74 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  50.77 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  53.59 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  53.98 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  52.66 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  52.17 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  50.75 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  52.38 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  55.67 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  49.13 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  51.16 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  52.04 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  52.04 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  52.04 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  52.91 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  52.65 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  50.38 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  50.52 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  51.2 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  49.36 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  50.75 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  52.84 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  47.64 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  53.2 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  50.64 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  49.37 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  51.17 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  50.39 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  47.56 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  48.49 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  45.7 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  44.76 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  46.95 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  46.15 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  46.15 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  46.31 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  45.26 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  50 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  45.37 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  51.95 
 
 		 406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  43.5 
 
 		 417 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  43.5 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  42.37 
 
 		 452 aa  342  8e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  50.87 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 		 396 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.43 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.3 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.07 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.81 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.11 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  40.93 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.36 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.68 
 
 		 396 aa  266  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.22 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 		 417 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.11 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  40.78 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  38.21 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  40.62 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.94 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  37.95 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  38.7 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.86 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  39.59 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>