More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3421 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  100 
 
 
420 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  74.51 
 
 
417 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  63.9 
 
 
410 aa  558  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  64.11 
 
 
410 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  60.49 
 
 
448 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  60.8 
 
 
414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  60.59 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  58.75 
 
 
409 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  57.93 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  54.81 
 
 
454 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  53.38 
 
 
452 aa  441  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  54.95 
 
 
435 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  50.74 
 
 
399 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  50.63 
 
 
398 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  50.5 
 
 
402 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  50 
 
 
396 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  50.38 
 
 
415 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  50 
 
 
396 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  50.62 
 
 
403 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  49.01 
 
 
396 aa  401  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
399 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  50.74 
 
 
409 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  49.13 
 
 
399 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  51.36 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  50.37 
 
 
402 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  48.51 
 
 
398 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  49.13 
 
 
396 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  48.38 
 
 
396 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  48.13 
 
 
396 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  47.88 
 
 
396 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  48.13 
 
 
396 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  51.91 
 
 
411 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  47.45 
 
 
415 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  47.13 
 
 
422 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  44.74 
 
 
407 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  45.09 
 
 
409 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  47.21 
 
 
404 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  46.63 
 
 
405 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  46.11 
 
 
403 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  44.33 
 
 
394 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  44.33 
 
 
394 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  45.18 
 
 
406 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  43.58 
 
 
416 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  44.36 
 
 
412 aa  355  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  45.69 
 
 
399 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  45.48 
 
 
396 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  45.18 
 
 
404 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  45.31 
 
 
427 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  43.5 
 
 
404 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  44.31 
 
 
413 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  45.82 
 
 
408 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  43.38 
 
 
424 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  45.64 
 
 
412 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  46.97 
 
 
408 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  44.47 
 
 
418 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  46.7 
 
 
680 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  44.56 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  43.42 
 
 
410 aa  338  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  43.32 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  44.17 
 
 
408 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  42.39 
 
 
403 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  42.16 
 
 
406 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  43.33 
 
 
408 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  43.33 
 
 
408 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  43.33 
 
 
408 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  40.38 
 
 
404 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  41.65 
 
 
407 aa  299  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.89 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  38.97 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  37.94 
 
 
402 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
398 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 
394 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  37.16 
 
 
418 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
395 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 
398 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 
396 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
394 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
394 aa  276  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 
396 aa  276  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  35.18 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.24 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.54 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  38.15 
 
 
396 aa  272  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  39.45 
 
 
400 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 
418 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  36.54 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.78 
 
 
395 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  35.86 
 
 
418 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  35.61 
 
 
397 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
399 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>