More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2247 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  100 
 
 		 418 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  70.33 
 
 		 424 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  63.16 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  64.36 
 
 		 407 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  68.46 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  67.69 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  64.76 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  64.9 
 
 		 403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  66.16 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  66.16 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  66.16 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  63.5 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  63.13 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  64.51 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  62.72 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  62.86 
 
 		 416 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  63.61 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  63.22 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  60.58 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  60.05 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  58.59 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  57.83 
 
 		 408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  64.3 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  59.69 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  63.09 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  58.93 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  52.14 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  51.64 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  50.85 
 
 		 415 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  51.26 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  48.61 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  48.51 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  46.94 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  46.94 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  46.94 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  47.19 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  46.94 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  46.68 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  52.82 
 
 		 412 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  53.3 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  45.84 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  45.45 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  46.67 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  45.45 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  47.37 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  50 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  50 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  45.29 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  47.34 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  46.08 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  44.8 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  50.52 
 
 		 408 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  45.39 
 
 		 448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  44.72 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  43.86 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  44.72 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  44.07 
 
 		 454 aa  355  7.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  44.15 
 
 		 417 aa  352  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  44.23 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  44.12 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  48.73 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  46.1 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  40.47 
 
 		 452 aa  335  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  46.45 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  42.64 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  42.64 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.62 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12345  ornithine aminotransferase (N-terminus part) rocD1  60.1 
 
 		 229 aa  252  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.03 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.76 
 
 		 477 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.93 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 393 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  37.44 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  32.92 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.46 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  33 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  36.62 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.08 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.3 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.22 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  35.81 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.3 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  32.56 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.3 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.3 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  35.89 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  33.68 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.58 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>