More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2516 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  100 
 
 
422 aa  854    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  88.37 
 
 
405 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  62.81 
 
 
409 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  65.49 
 
 
411 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  56.63 
 
 
415 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  55.47 
 
 
402 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  57.43 
 
 
403 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  54.99 
 
 
398 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  59.95 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  58.5 
 
 
408 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  56.07 
 
 
399 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  61.97 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  53.32 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  53.32 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  53.32 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  53.32 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  53.06 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  53.06 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  53.06 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  53.06 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  53.06 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  52.3 
 
 
396 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  55.05 
 
 
415 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  52.04 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  54.08 
 
 
396 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  54.22 
 
 
396 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  54.08 
 
 
396 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  60.53 
 
 
412 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  51.79 
 
 
399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  55.81 
 
 
410 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  51.53 
 
 
399 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  52.91 
 
 
406 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  53.83 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  53.54 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  50.5 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  49.12 
 
 
394 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  49.12 
 
 
394 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  53.02 
 
 
404 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  50.13 
 
 
402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  52.47 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  54.31 
 
 
680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  52.67 
 
 
416 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  51.8 
 
 
412 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  51.04 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  51.64 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  51.9 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  52.11 
 
 
409 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  51.65 
 
 
404 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  49.25 
 
 
417 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  48.62 
 
 
403 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  50.12 
 
 
407 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  48.48 
 
 
410 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  51.02 
 
 
404 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  47.13 
 
 
420 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  47.77 
 
 
414 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  51.4 
 
 
408 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  51.4 
 
 
408 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  51.78 
 
 
415 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  50.5 
 
 
413 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  51.4 
 
 
408 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  46.02 
 
 
454 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  46.98 
 
 
409 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  48.63 
 
 
408 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  47 
 
 
410 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  45.8 
 
 
452 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  51 
 
 
404 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  44.94 
 
 
417 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  45.93 
 
 
448 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  48.73 
 
 
418 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  43.96 
 
 
435 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  50.65 
 
 
406 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  44.2 
 
 
425 aa  343  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  50 
 
 
407 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.36 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.19 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.33 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.35 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.93 
 
 
395 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.16 
 
 
396 aa  300  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
392 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 
400 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
397 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.93 
 
 
395 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
397 aa  292  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
417 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 
402 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 
394 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.56 
 
 
398 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.28 
 
 
410 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.55 
 
 
398 aa  290  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.4 
 
 
400 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.71 
 
 
399 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
390 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.52 
 
 
395 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  41.34 
 
 
391 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.49 
 
 
398 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  39.03 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.37 
 
 
403 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>