More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4523 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  100 
 
 
413 aa  832    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  66.5 
 
 
404 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  67 
 
 
404 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  65.41 
 
 
412 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  63.03 
 
 
403 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  65.05 
 
 
406 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  65.14 
 
 
416 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  66.23 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  66.07 
 
 
409 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  63.43 
 
 
407 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  62.24 
 
 
427 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  61.31 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  63.04 
 
 
404 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  61.68 
 
 
424 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  62.21 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  62.21 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  61.25 
 
 
680 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  62.21 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  61.21 
 
 
403 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  59.95 
 
 
408 aa  494  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  60.8 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  60.97 
 
 
404 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  58.72 
 
 
396 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  58.59 
 
 
418 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  55.87 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  60.98 
 
 
407 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  62.3 
 
 
406 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  49.5 
 
 
399 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  51.65 
 
 
402 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  52.22 
 
 
402 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  49.87 
 
 
398 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  49.87 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  50.38 
 
 
396 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  51.77 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  50.38 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  50.13 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  50.63 
 
 
399 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  54.36 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  52.28 
 
 
414 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  48.84 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  48.84 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  48.07 
 
 
396 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  50.38 
 
 
408 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  49.49 
 
 
417 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  48.23 
 
 
415 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  47.58 
 
 
394 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  47.58 
 
 
394 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  48.11 
 
 
410 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  53.02 
 
 
411 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  50.38 
 
 
409 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  51.7 
 
 
410 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  51.03 
 
 
408 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  47.44 
 
 
409 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  52.42 
 
 
408 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  46.78 
 
 
425 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  50.5 
 
 
422 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  47.33 
 
 
410 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  45 
 
 
454 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  49.36 
 
 
405 aa  356  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  45.71 
 
 
417 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  44.31 
 
 
420 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  44.64 
 
 
448 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  44.12 
 
 
435 aa  346  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  43.89 
 
 
452 aa  345  8e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.18 
 
 
395 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.5 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
394 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  37.84 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.07 
 
 
401 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.47 
 
 
385 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.29 
 
 
395 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
391 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 
395 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.86 
 
 
393 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
402 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
410 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
399 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.29 
 
 
395 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  34.5 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  34.34 
 
 
396 aa  244  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
399 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
395 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.64 
 
 
401 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  38.3 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
390 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.32 
 
 
477 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>