55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  71.16 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  61.71 
 
 		 280 aa  339  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  62.17 
 
 		 278 aa  331  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  61.19 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  58.58 
 
 		 269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  60.45 
 
 		 271 aa  325  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  60.22 
 
 		 275 aa  309  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  57.62 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  56.88 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  61.94 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  58.87 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  57.09 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  58.58 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  57.45 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  58.36 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  54.48 
 
 		 680 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  54.89 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  54.89 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  54.89 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  54.98 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  56.34 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  58.3 
 
 		 277 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  54.31 
 
 		 281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  52.81 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  53.36 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  53.99 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  53.38 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  42.96 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.26 
 
 		 705 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.93 
 
 		 705 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  36.26 
 
 		 705 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  36.67 
 
 		 703 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.04 
 
 		 704 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  35.19 
 
 		 703 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  36.4 
 
 		 703 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  38.21 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  32.16 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  31.56 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  32.86 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  32.73 
 
 		 294 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  31.07 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  28.25 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  22.55 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  26.42 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.73 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  25.53 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  25.51 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  21.35 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  24.21 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  25 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  23.6 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  21.72 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  21.49 
 
 		 263 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>