162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0765 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  37.98 
 
 
304 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  33.8 
 
 
283 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  28.22 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  27.08 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  29.8 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  27.46 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  30.52 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  28.8 
 
 
418 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  30.59 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  26.94 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  30.68 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  27.17 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  21.43 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  28.46 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  25.87 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  22.98 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  29.72 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  27.56 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  29.32 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  24.81 
 
 
401 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  22.9 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  25.1 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  25.74 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  24.09 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  29.3 
 
 
436 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  28.8 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  23.77 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  28.8 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  28.8 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  24.57 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  28.03 
 
 
407 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  26.77 
 
 
401 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  25.48 
 
 
405 aa  63.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  28.11 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  26.05 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  29.34 
 
 
407 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  24.58 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  24.55 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  24.17 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  28.69 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  24.41 
 
 
403 aa  57.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  25.17 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  25.69 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  24.44 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  25.17 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  25.17 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  24.1 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  23.05 
 
 
405 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  25 
 
 
406 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  24.62 
 
 
414 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  24.53 
 
 
410 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  25.48 
 
 
410 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  26.42 
 
 
434 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  21.45 
 
 
408 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  23.75 
 
 
418 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  23.78 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  27.31 
 
 
409 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  25.81 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  26.36 
 
 
409 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  26.21 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  25.75 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  25.39 
 
 
410 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  25.55 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  22.68 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  29.17 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  25.57 
 
 
405 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  24.17 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  24.17 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  25 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  25.1 
 
 
680 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  25.56 
 
 
413 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  22.04 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  22.45 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  24.2 
 
 
703 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  22 
 
 
405 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  26.74 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  27.57 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  23.66 
 
 
408 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  26.17 
 
 
405 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  26.55 
 
 
397 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  23.94 
 
 
418 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  22.94 
 
 
406 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  23.94 
 
 
419 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  23.94 
 
 
418 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  23.28 
 
 
410 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  23.53 
 
 
406 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  27.05 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  23.92 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  20.57 
 
 
703 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  22.78 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  27.67 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  22.56 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  22.56 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  24.03 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  22.3 
 
 
410 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  24.22 
 
 
409 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  24.9 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  22.7 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  24.9 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>