65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  96.46 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  60.39 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  58.04 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  57.81 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  56.47 
 
 		 263 aa  301  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  48.63 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  46.85 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  41.02 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  43.75 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  43.36 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  42.58 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  42.19 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  38.74 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  41.02 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  40.94 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  32.6 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  34.9 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  33.19 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  29.13 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  33.17 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 387 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  24.81 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  26.2 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  23.45 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  25.76 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.02 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  25.95 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  27.2 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  25.63 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  22.52 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  29.41 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  24.48 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  26.12 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  22.45 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.83 
 
 		 705 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  23.08 
 
 		 703 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  24.47 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  27.34 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  26.71 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.78 
 
 		 704 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  28.19 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  23.21 
 
 		 703 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  24.57 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  30.61 
 
 		 432 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  23.11 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  22.17 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.87 
 
 		 703 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  25.34 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.24 
 
 		 705 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.24 
 
 		 705 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  22.63 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  27.08 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  22.89 
 
 		 431 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  25.12 
 
 		 409 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  22.08 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  22.08 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  22.08 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  23.01 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  27.59 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  23.08 
 
 		 409 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  22.55 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>