57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  77.52 
 
 
258 aa  421  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  72.16 
 
 
263 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  67.84 
 
 
256 aa  359  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  56.47 
 
 
254 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  56.47 
 
 
254 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  47.45 
 
 
255 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  47.84 
 
 
255 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  43.14 
 
 
257 aa  225  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  43.36 
 
 
256 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  42.58 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  42.58 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  42.58 
 
 
256 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  41.8 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  42.19 
 
 
256 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  41.8 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  43.46 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  38.82 
 
 
253 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  37.93 
 
 
264 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  31.17 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  31.52 
 
 
262 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  30.35 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
387 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 
368 aa  99  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  31.84 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  30.2 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  28.16 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  25.53 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  24.89 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  25.42 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  25.86 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  22.07 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  25 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  23.75 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  21.37 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  21.43 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  28.67 
 
 
680 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  23.91 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  22.65 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  21.14 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1089  amidinotransferase  21.95 
 
 
415 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  27.43 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  31.48 
 
 
432 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.31 
 
 
705 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  22.69 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  22.31 
 
 
705 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  23.95 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  23.71 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.76 
 
 
703 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  24.38 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3009  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.52 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  24.5 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  23.67 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  24.3 
 
 
704 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  24.5 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  25.52 
 
 
333 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  25.68 
 
 
406 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>