66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1658 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  100 
 
 
262 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  50.4 
 
 
257 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  53.2 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  34.63 
 
 
258 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  36.22 
 
 
256 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  33.59 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  33.98 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  38.25 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  38.74 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  34.24 
 
 
258 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  38.34 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  37.85 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  37.05 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  37.05 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  37.05 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  36.22 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  30.59 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  31.52 
 
 
263 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  29.8 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  34.77 
 
 
254 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  34.9 
 
 
254 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  33.07 
 
 
253 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 
387 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  30.68 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 
368 aa  72  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  26.05 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  29.05 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  28.23 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  23.93 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  26.97 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  27.76 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  25.83 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  27.31 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  27.31 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  27.31 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  25.73 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  27.27 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  25.93 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  25.41 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  27.57 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  26.32 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  31.01 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  25.82 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  24.71 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  22.32 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  25.61 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  25.42 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  28.37 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  24.69 
 
 
302 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  27.88 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  24.38 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  26.03 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  28.69 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  25.63 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  25.51 
 
 
680 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  25.45 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  25.51 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7150  amidinotransferase  25.61 
 
 
395 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0977  non-specific serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3760  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 
397 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408219  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3451  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 
397 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  25.83 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3649  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6335  non-specific serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
409 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  24.82 
 
 
453 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  27.08 
 
 
406 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>