More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4475 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 368 aa  736    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  31.58 
 
 		 258 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  29.91 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  31.25 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  28.63 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  28.19 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  28.63 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  27.27 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 126 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 128 aa  93.2  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  29.69 
 
 		 256 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 128 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 125 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  38.02 
 
 		 126 aa  90.5  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  30.26 
 
 		 256 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  30.26 
 
 		 256 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  30.26 
 
 		 256 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  30.26 
 
 		 256 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  29.74 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  27.07 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  26.43 
 
 		 255 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  37.19 
 
 		 129 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40.52 
 
 		 134 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  25.99 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  26.79 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  23.45 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  39.17 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 124 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  39.5 
 
 		 126 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  39.5 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  23.01 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 128 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 140 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  36.07 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 124 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 128 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.13 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.45 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  34.68 
 
 		 124 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  35.25 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  31.15 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 129 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.68 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  38.02 
 
 		 135 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 124 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 128 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 124 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 151 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  39.83 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.95 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>