49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4094 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  47.86 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  47.47 
 
 
255 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  46.72 
 
 
256 aa  235  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  45.77 
 
 
258 aa  229  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  44.92 
 
 
257 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  41.02 
 
 
254 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  41.02 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  43.46 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  42.41 
 
 
253 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  42.47 
 
 
263 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  41.63 
 
 
256 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  41.63 
 
 
256 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  41.63 
 
 
256 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  41.63 
 
 
256 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  41.25 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  40.86 
 
 
252 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  41.25 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  36.68 
 
 
264 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  36.4 
 
 
258 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  33.59 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  32.95 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  34.51 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  28.45 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  27.07 
 
 
368 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  27.11 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.86 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  20.76 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  27.35 
 
 
279 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  25 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  20.76 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  25.1 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  27.8 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  30.2 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  26.12 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  24.9 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  29.32 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  23.56 
 
 
680 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  25.83 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2115  amidinotransferase  24.38 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  26.34 
 
 
292 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  27.19 
 
 
286 aa  45.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  24.47 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  24.09 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  22.27 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  30.38 
 
 
432 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  21.17 
 
 
705 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  22.59 
 
 
703 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>