74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1816 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  55.78 
 
 
252 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  54.98 
 
 
256 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  54.98 
 
 
256 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  54.98 
 
 
256 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  54.58 
 
 
256 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  52.99 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  55.38 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  54.98 
 
 
252 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  45.95 
 
 
263 aa  243  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  46.85 
 
 
254 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  46.85 
 
 
254 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  46.88 
 
 
256 aa  240  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  47.06 
 
 
258 aa  238  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  45.49 
 
 
255 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  45.49 
 
 
255 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  43.14 
 
 
263 aa  225  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  44.92 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  36.11 
 
 
264 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  35.74 
 
 
387 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  36 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  36.61 
 
 
257 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  36.22 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  36.65 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  31.93 
 
 
271 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  34.66 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  22.18 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  32 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  23.77 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  26.16 
 
 
680 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.17 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  26.34 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  26.02 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  32.43 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  28.78 
 
 
320 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  26.34 
 
 
292 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  33.6 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  25.62 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  23.11 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  29.01 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  33.11 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  26.23 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  24.9 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  24.26 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  24.79 
 
 
279 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  24.68 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  24.68 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  24.68 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  24.68 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  30.15 
 
 
407 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  27.71 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  28.75 
 
 
409 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  27.61 
 
 
410 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  26.55 
 
 
419 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  26.55 
 
 
406 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  23.65 
 
 
302 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0246  amidinotransferase  31.63 
 
 
432 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  26.55 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  28.68 
 
 
406 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  25.53 
 
 
414 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  25.95 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  26.55 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  26.55 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  26.55 
 
 
406 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  26.24 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  28.27 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  25.23 
 
 
403 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  29.41 
 
 
406 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  25.17 
 
 
418 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  26.78 
 
 
406 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  25.15 
 
 
418 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  27.21 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  23.68 
 
 
406 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>