150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0020 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  85.02 
 
 		 287 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1759  amidinotransferase  34.88 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  31.45 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  30.74 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  25.26 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  24.81 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  26.4 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  28.47 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  25.56 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  27.92 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  29.8 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  30.04 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  34.66 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1693  arginine deiminase  22.51 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  27.14 
 
 		 406 aa  72.4  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.53 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  29.8 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  27.56 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  26.38 
 
 		 410 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  25.93 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  27.56 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  27.11 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  26.38 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  29.91 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  26.38 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  27.31 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  27.14 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  25.98 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  25.83 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  30.16 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  27.14 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  27.14 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  27.27 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  27.14 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  27.14 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  27.14 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  27.14 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  27.14 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  26.59 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  30.26 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  26.42 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  25.63 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  25.13 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  30.57 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  27.46 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  25.38 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  25.64 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  26.13 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  29.79 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  29.26 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  26.94 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  23.74 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  25.64 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  26.85 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  24.21 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  29.79 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  26.4 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  25.13 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  27.18 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  27.18 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  23.27 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  29.38 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  27.18 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  23.12 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  26.67 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  26.74 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  24.8 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  26.8 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  27.69 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  26.67 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  26.05 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  23.74 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  28.14 
 
 		 434 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  29.02 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  29.02 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  29.02 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  27.91 
 
 		 680 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  30.77 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  25.2 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  26.26 
 
 		 417 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  22.35 
 
 		 411 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  28.37 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  25.59 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  25.76 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  29.26 
 
 		 402 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  25.63 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  24.45 
 
 		 414 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.9 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  26.77 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  28.72 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  22.9 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  26.02 
 
 		 409 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  22.9 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  26 
 
 		 419 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  24.29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  28.14 
 
 		 407 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  24.62 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  24.78 
 
 		 453 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>